Научный сборник, ежегодно издаваемый с 2001 года под названием «Azərbaycan Tarixi Muzeyi» («Музей истории Азербайджана»), а с 2007 года — «Milli Azərbaycan Tarixi Muzeyi» («Национальный музей истории Азербайджана»), является продолжением серии сборников научных статей, издававшихся музеем ещё с 1950-х годов и посвящённых результатам проводимых здесь научно-исследовательских работ.