Фонд оружия и знамен был организован в 2009 г. на основе Фонда новой истории, созданного в 1955 г. В фонде хранится 1575 экспонатов. Среди них – образцы оборонительного, холодного и огнестрельного оружия (кольчуги, щиты, мечи, ружья, пушки и др.), изготовленные на Кавказе, в том числе в Азербайджане, в странах Востока, Европы, в России, а также знамена эпохи ханств, знамена воинских дивизий, государственные флаги разных республик.

Оружие, хранящееся в фонде, свидетельствует о высоком уровне оружейного производства и профессионализме азербайджанских оружейников. Материалы фонда неоднократно использовались в музейной экспозиции и на различных выставках, в том числе на выставках, охватывающих непосредственно коллекцию фонда – «Восточное оружие и знамена» (1999), «Меч, вонзенный в землю» (2012), I Азербайджанской Международной выставке оборонной промышленности, организованной Министерством оборонной промышленности Азербайджанской Республики (2014), II Азербайджанской Международной выставке оборонной промышленности, организованной Министерством оборонной промышленности Азербайджанской Республики (2016), III Азербайджанской Международной выставке оборонной промышленности, организованной Министерством оборонной промышленности Азербайджанской Республики (2018), выставке в городе Гяндже (2014), выставке, посвященной 70-летию победы во Второй мировой войне, организованной Национальным музеем истории Азербайджана (2015), выставке «Шах Исмаил – правитель и полководец» (2016), выставке «Государство Ширваншахов» (2017), выставке «Азербайджанская национальная одежда как она есть», выставке, посвященной 100-летию освобождения Баку Кавказской Исламской Армией (2018), выставке «Выдающиеся деятели АДР» (2018), выставке «Адмирал Джавадов. Жизнь, война и служба» (2018), выставке «Шеки: наше великое наследие» (2019), выставке «Азербайджан во Второй мировой войне» (2020).  

Эти экспонаты, являющиеся свидетельствами наших национальных ценностей, военной истории, выставлялись неоднократно и на международных выставках: «Караван-сарай. Азербайджан – Страна огней» (Норвегия, г. Ставангер, 2006-2007), «Исторический взгляд на жемчужины Азербайджана» (Ватикан, 2012), «Азербайджан – страна огней» (Чехия, г. Острава, 2012-2013), «Азербайджан – Волшебная Страна огней» (Чехия, г. Прага, 2014), выставка «Азербайджан в годы Великой Отечественной войны» на площадке ВДНХ (2019) и т. д.

На основе материалов фонда изданы книги альбомы «Государственность в Азербайджане и ее символы» (2000), «Жемчужины Национального музея истории Азербайджана» (2010), каталоги «Знамена Азербайджана» (2005), «Оборонительное оружие Азербайджана» (2012), подготовлен каталог «Холодное и огнестрельное оружие Азербайджана», сняты различные телевизионные фильмы.

Руководителями фонда в разные годы являлись: Фикрет Сулейманов (1955-1965), Сара Джахангирова (1965-2002).Севиндж Вахабова (2002-2021 гг.), с 2021 г. фонд возглавляет Гатиба Гасанова.